Географическое положение и своеобразный ландшафт района Кавказских Минеральных Вод обуславливают разнообразные климатические условия курортов. Район расположен на наклонной плоскости — юго-западная часть приподнята в сторону Большого Бермамыта на высоту абсолютной отметки — 2643 метра, а северная и северо-восточная (у железнодорожной станции Минеральные Воды) опускается до 400 метров. Уже разница в высотном расположении определяет различия климатических условий.
По климату район курортов можно условно разделить на южную и северную зоны. Южная зона, с чертами континентального климата и низко- и среднегорья, по своим климатическим и погодным условиям является наиболее благоприятной для лечебных целей. В этой зоне находиться Кисловодская долина, надежно прикрытая прилегающими Джинальским и Богустанским хребтами.
Они ограждают Кисловодск от неблагоприятных ветров, низкой облачности и туманов, которые проникают в этот район из прикаспийских степей. Климат Кисловодска ровный, солнечный и безветренный, умеренно влажный. Многолетние наблюдения подтверждают эту характеристику, определяющую Кисловодска как местностью характерную некоторым понижением атмосферного давления, сниженным парциальным давлением кислорода и водяных паров. Воздух здесь чист и прозрачен.
Интенсивность солнечной и особенно ультрафиолетовой радиации повышена, особенно в летнем сезоне. За год число часов солнечного сияния достигает 2093, только 37 дней в году бывает без солнца. Зима в Кисловодске солнечная и сухая. Снежный покров держится 40-45 дней. Все эти факторы позволяют считать Кисловодск одной из лучших низкогорных климатических станций.
Северная зона Кавказских Минеральных Вод по климатическим условиям несколько отличается от южной. Располагается она на уровне 650-400 метров на плоскости, открытой для северных и восточных ветров прикаспийских степей. Климат этой зоны имеет выраженные черты степного континентального, с большим количеством тепла. Среднегорный уровень осадков невелик и составляет около 600 мм.
По сравнению с южной зоной здесь выше среднегодовая температура воздуха и его влажностью. Число дней с туманами и без солнца 82-92, число дней с осадками 120-160. Пасмурные дни с туманами и изморозью бывают преимущественно в осенне-зимний период, что и создает заметный контраст с южной зоной. В северной зоне находятся курорты Ессентуки, Пятигорск и Железноводск. Как показали многолетние наблюдения, в теплую половину года и в северной зоне создаются благоприятные биоклиматические условия и успешно проходит климатолечение.